Lamentablemente, en El Suace no hay un Cuerpo de Bomberos, por lo que dicha tarea se realizó con baldes, haciendo cadenas humanas, llevando agua de las casas de los vecinos del Templo. Algunos iban al río a traer agua; ya que en El Sauce no había agua potable, porque, para prevenir que el incendio se propagara por todo la ciudad, se corto la energia eléctrica, lo que detuvo el funcionamiento de las bombas de agua.

Se lamentó la pérdida del nicho donde vino la venerada imagen a El Sauce, procedente de Guatemala, la mesa del Altar y las imágenes de la réplica del Cristo que estaban en el Altar Mayor, San Francisco, Santo Domingo, San Juan , la Inmaculada Concepción y el Nacimiento que había sido colocado con motivo de la Navidad.

La organización de los trabajos o comité de restauración  encabezados por monseñor Francisco Leiva, presidente; Dra.  Concepción Palacios, vicepresidente; Alfonso Narváez y Agustín Moreno, secretario y tesorero; Sergio García Pinell, fiscal de la  directiva, están llamando a unir esfuerzos con todas las entidades para rescatar de las cenizas y volver a la vida a través de la restauración, este templo, orgullo de la feligresía nicaragüense y países aledaños.

El proyecto de restauración del Santuario de Esquipulas o Cristo Negro fue elaborado por la  arquitecta María Gertrudis Palacios Pastora, sauceña, que dirigió la ejecución de la primera  fase que contempla la protección de áreas salvadas, construcción del techo del presbiterio, capilla, sacristía, laberinto y corredores. la segunda fase de restauración del santuario consta de tres etapas y asegura que la cuarta o inmediata es vital para garantizar la preservación del templo.El valor total de la restauración del Santuario Nacional de El Sauce fue valorado en 509 mil 766 dólares. El sacerdote Francisco Javier Saravia, administrador parroquial del Santuario de El Sauce y  párroco de El Jicaral y Santa Rosa, reconoció la labor de la arquitecta Palacios, 

El sacerdote  Padre Bernardo Martínez  se encarga de la administración parroquial y continua con rapidez la obra”,   El nombramiento de un nuevo párroco, la disposición de voluntariado y la participación de la sociedad civil de aquella ciudad, permitió el inicio de la segunda fase de reconstrucción y restauración del Santuario Nacional del Señor de Esquipulas, destruido por un incendio el 26 de diciembre de 1997.

La segunda fase de la obra estaba valorada en 320 mil 061 dólares. Esta fase estaba dividida en tres etapas en las que se ejecutarian la construcción del techo, estructura, cielo raso, sistema eléctrico de la asamblea, altares y coro. Además se instalarian el cielo raso y piso en el presbiterio. Las obras eran dirigidas por el padre Xavier Saravia, nombrado párroco por la Diócesis en Febrero del 2001, El habia estado al frente del proceso de reconstrucción del templo desde su inicio en 1998, y la arquitecta María Gertrudis Palacios Pastora, ciudadana sauceña que elaboró el proyecto y preside el comité técnico.

 Columnas, techos, altares desaparecidos el 26 de diciembre de 1997  no han sido suficientes para borrar completamente la iglesia. Las paredes de adobe, a pesar del fuego han quedado intactas en un 90  por ciento y pueden, según consultas estructurales a profesionales,  volver a ser utilizadas.

Las obras de reconstrucción y restauración del Santuario que ahora contiene un museo, estában valoradas en 509 mil 766 dólares. 

Éstas fueron posibles con la ayuda económica de la comunidad sauceña de dentro y fuera de la ciudad, actividades realizadas por el comité y aportes del Gobierno Central.

En octubre de 1998, la Presidencia de la República orientó al Ministerio de Hacienda y Crédito Público que del presupuesto nacional se asignaran 200 mil córdobas anuales, con posibilidades de incremento de acuerdo a las necesidades, para la ejecución del proyecto hasta su finalización.